/academic/

• ../
• 3D-ICE
• AlphaPlot
• CAFS_divergence
• CAPS_coevolution
• DRAMPower
• DRAMSim2
• DRAMSys
• DRAMsim3
• Data2FCS
• DendroPy
• EMBASSY
• EMBOSS
• FCSalyzer
• FreeFem
• Gabedit
• Gblocks
• GeoGebra
• Gridcoin-Research
• HMMER
• IGV
• ITK
• Kst
• MetaPhlAn2
• NWChem
• OpenFOAM
• OpenMM
• OpenVSP
• PhyML
• PyAMG
• R
• RAxML
• RepeatMasker
• STAR
• SU2
• SeqMonk
• Shark
• SimEng
• TreeGraph
• ViennaRNA
• WEVOTE
• WolframEngine
• WordNet
• ZeGrapher
• abntex
• aenig4
• aeskulap
• aline
• aliview
• amd
• amplicon
• amplifx
• antiprism
• archaeopteryx
• aris
• arka
• armadillo
• arpack-ng
• arpack
• artha
• avl
• avogadroapp
• avogadrolibs
• bcftools
• bedGraphToBigWig
• bedtools
• biblesync
• bibletime
• bibus
• biopython
• boinc
• bowtie
• bowtie2-legacy
• bowtie2
• bpp-core
• bpp-phyl-omics
• bpp-phyl
• bpp-popgen
• bpp-seq-omics
• bpp-seq
• bpp1.9-numcalc
• bpp1.9-phyl
• bpp1.9-seq
• bpp1.9-utils
• bppsuite
• btf
• bwa
• cadabra2
• calc
• calcoo
• camd
• cap3
• cblas
• ccolamd
• cdo
• celestia
• chartgeany
• chemtool
• cholmod
• cistrome-CEAS
• cistrome-MACS
• cistrome-conductGO
• cistrome-extra
• cistrome-mdseqpos
• clark-ugene
• cld2
• clustalo
• clustalw
• clustalx
• colamd
• colin
• convertall
• copasi
• cryptominisat
• csparse
• cufflinks
• cutadapt
• cvc4
• cxsparse
• dakota
• datamash
• diamond
• dimod
• ds9
• dwave-cloud-client
• dwave-greedy
• dwave-hybrid
• dwave-inspector
• dwave-neal
• dwave-networkx
• dwave-ocean-sdk
• dwave-preprocessing
• dwave-system
• dwave-tabu
• dwavebinarycsp
• easy_spice
• ed-v6
• edsim51di
• elk
• engauge
• ent
• eprover
• equalx
• ess
• evopedia_qt
• exonerate
• extrema
• fann
• fastqc
• fet
• fiji
• finchtv
• fityk
• flann
• flexbar
• free42
• g3data
• galculator
• gaw3
• gchemutils
• gcompris-qt
• geda-gaf
• gelemental
• gem5
• geneconv
• genius
• genometools
• genpak
• geomview
• gerbv
• getdp
• getfem
• ggobi
• ghemical
• glpk
• glvis
• gmsh
• gnucap
• gp2fasta
• gpredict
• grace
• gresistor
• gretl
• gri
• gromacs
• grpn
• gspiceui
• gtkwave
• gtypist
• gwyddion
• h5utils
• harminv
• hyphy
• iTest
• io_lib
• iqtree
• irsim
• isoelectric-point
• itex2mml
• jalview
• jellyfish_k-mer
• jpicedt
• jugglinglab
• karma
• klavaro
• klu
• knime
• kraken
• ktikz
• kurso
• labplot2
• ladr
• laghos
• lalnview
• lapack95
• lapacke
• latex2html
• ldl
• libghemical
• link-grammar
• locarna
• lpsolve
• mafft
• magic
• mathics
• mathjax2
• mathomatic
• matio
• maxima
• meep
• megax
• meme-db-gomo
• meme-db-motif
• meme-db-tgene
• meme-suite
• mendeleydesktop
• metalwalls
• metis
• mfem
• minorminer
• mkDSSP
• molequeue
• mpb
• mrbayes
• mumsa
• muscle
• muscle5
• ncbi-blast+
• ncbi-blast
• ncbi-rmblastn
• nco
• ncview
• ngspice
• novocraft
• octave
• openboard
• pal2nal
• paml
• pamlX
• papi
• pari
• parmetis
• patsy
• pcalc
• pcb
• penaltymodel
• perlprimer
• petsc
• pianobooster
• plasmidomics
• plus42
• pomoxis
• prank-msa
• primer3
• pspp
• pulseview
• pyCRAC
• pyfits
• pysam
• python2-kiwisolver
• python2-scipy
• python3-ase
• python3-scipy
• qalculate-gtk
• qcl
• qhull
• qrupdate
• qucs-s
• qucs
• ramulator
• rbio
• reduce-algebra
• root
• rpy2
• sage-bin
• sage
• samtools-legacy
• samtools
• scidavis
• scilab
• seaview
• seqkit
• sequence-analysis
• sigrok-cli
• siril
• smath-studio
• snpEff
• solfege
• spades
• speedcrunch
• spiceopus
• spidey
• spqr
• squizz
• staden
• stellarium
• stellarsolver
• stringtie
• suitesparse
• suitesparseconfig
• sundials
• sword-data-kjv
• sword
• t_coffee
• tabix-legacy
• tiemu
• tilem
• tilem2
• tkgate
• topdraw
• tophat
• treebest-ensembl
• treeviewx
• trfind
• trimmomatic
• tuxmath
• tuxtype2
• ucsc-blat
• ugene
• umfpack
• units
• vCAPS_coevolution
• vcftools
• velocyto
• verilator
• verilog
• veusz
• voro++
• wehi-cellsymphony
• wehi-deid
• wehi-hackit
• wehi-weasel
• wmcalc
• wxMaxima
• x48
• xcircuit
• xephem
• xflr5
• xfoil
• xiphos
• xoscope
• xsimd
• yices2
• z3
• zotero